More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6216 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  85.09 
 
 		 230 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  46.48 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  36.49 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  39.63 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  43.22 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  36.87 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  35.56 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  41.23 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.46 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 137 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  26.73 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  29.1 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 119 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  33.59 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.82 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.82 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.86 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 120 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 147 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 118 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  67.4  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 147 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  36.46 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.61 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 110 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>