More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1397 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  46.96 
 
 		 191 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  51.92 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 169 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  38.74 
 
 		 174 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40.8 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  34.26 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  38.02 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  35.58 
 
 		 222 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 210 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  32.43 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  37.19 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 237 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  35.65 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  35.65 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  33.96 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>