More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4650 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  60.23 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  59.32 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  62.58 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  53.94 
 
 		 209 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 171 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  55.77 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  49.37 
 
 		 168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  49.37 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  54.07 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  51.11 
 
 		 149 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  52.27 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  57.26 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 147 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  53.03 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  48.68 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  45.34 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.13 
 
 		 148 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  41.13 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  43.17 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  44.29 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  46.97 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40.94 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.22 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.06 
 
 		 268 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.28 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.28 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.28 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.28 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  46.28 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 244 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  40.97 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  38.35 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  45.53 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  38.06 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 290 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  39.55 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 318 aa  97.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  43.14 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.6 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  41.6 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>