More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2369 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  66.9 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  67.36 
 
 		 187 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  66.21 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  62.34 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  63.77 
 
 		 149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 149 aa  171  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  51.03 
 
 		 177 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  52.27 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  47.33 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  48.68 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  50.37 
 
 		 172 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 209 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  40.97 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.77 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  44.72 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  39.71 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  38.13 
 
 		 212 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  38.69 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.99 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.06 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  36.84 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  36.51 
 
 		 268 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 280 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  36.51 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  36.51 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 290 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  34.53 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  33.81 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.9 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  37.86 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.29 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  37.86 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  33.58 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5101  HxlR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>