More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05500 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  51.63 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  45.62 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  47.77 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  48.37 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.79 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  42.48 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.92 
 
 		 188 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  42.03 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.94 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  42.52 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 310 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  38.35 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  41.79 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.97 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 318 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 295 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  48.91 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  48.91 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  37.86 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 209 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  37.88 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  37.32 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 290 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.27 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.27 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.27 
 
 		 268 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 244 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 140 aa  94.4  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  38.06 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  43.01 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  34.67 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 106 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 280 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.23 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  38.97 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  38.97 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  33.81 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>