More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3271 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  345  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  67.31 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  48.05 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  37.91 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.3 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  52.22 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  34.85 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 209 aa  95.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  34.85 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 310 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  41.23 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  47.78 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  34.59 
 
 		 186 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  43.01 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 318 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  34.87 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  37.24 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  38.21 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.37 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 290 aa  87.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 121 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  34.03 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  34.03 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 244 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  32.85 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  39.81 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>