More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2492 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  94.19 
 
 
158 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  80.54 
 
 
162 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  80.54 
 
 
162 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  80.54 
 
 
162 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  77.27 
 
 
160 aa  260  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  77.27 
 
 
160 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  79.19 
 
 
162 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  79.87 
 
 
160 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  62.67 
 
 
159 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  57.62 
 
 
188 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  53.95 
 
 
157 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  54.61 
 
 
157 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
150 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
163 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
149 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  47.77 
 
 
162 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  51.45 
 
 
153 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
170 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  51.06 
 
 
157 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  47.1 
 
 
157 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 
166 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  49.03 
 
 
176 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  51.45 
 
 
161 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  44.76 
 
 
158 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
318 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
167 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  44.74 
 
 
177 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40.88 
 
 
165 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
156 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  47.29 
 
 
193 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  45.07 
 
 
151 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  41.55 
 
 
165 aa  117  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 
149 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  45.04 
 
 
143 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
310 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.69 
 
 
170 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.28 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
165 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  111  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 
168 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 
307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.12 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 
161 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
155 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.49 
 
 
168 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 
170 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  38.03 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
168 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 
177 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  50 
 
 
131 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
193 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 
158 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
183 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
183 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
147 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 
147 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  38.82 
 
 
183 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  49.49 
 
 
187 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
295 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 
290 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
168 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
149 aa  101  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.85 
 
 
148 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  42.54 
 
 
159 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  38.13 
 
 
158 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 
160 aa  98.6  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 
280 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  34.64 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 
147 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 
150 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 
244 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
165 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
171 aa  95.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
285 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 
172 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  37.25 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.71 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 
149 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  36.76 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
135 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
171 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.3 
 
 
148 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
147 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
151 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>