More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1643 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  320  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  46.38 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.84 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 244 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.84 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.13 
 
 		 268 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  43.07 
 
 		 209 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.33 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  40.88 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  40.44 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  37.86 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  39.39 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  38.69 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 280 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  38.85 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  36.3 
 
 		 212 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.24 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  38.73 
 
 		 177 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.6 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  36.3 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.51 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  41.26 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 290 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.68 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  34.75 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  39.37 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.79 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  44.26 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>