More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3961 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 183 aa  369  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 183 aa  369  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  82.93 
 
 		 183 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  57.25 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  51.68 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  53.24 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  42.75 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.74 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  43.17 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  42.96 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  43.75 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  41.48 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  42.62 
 
 		 153 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.83 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  43.67 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.14 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  39.6 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  38.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  52 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 		 121 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 162 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 310 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  38.1 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  39.55 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44.19 
 
 		 143 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  37.65 
 
 		 209 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 152 aa  94.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.6 
 
 		 152 aa  94.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 135 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.37 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.37 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.37 
 
 		 268 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  42.61 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 244 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 165 aa  91.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.09 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>