More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4546 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  72.29 
 
 		 172 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  62.96 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  64.81 
 
 		 161 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  62.87 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  60.11 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  59.12 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  52.53 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  50.63 
 
 		 168 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  54.76 
 
 		 149 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  51.33 
 
 		 147 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  54.4 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  51.82 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  46.98 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 147 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 149 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 156 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  47.29 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 162 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  45.59 
 
 		 154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  45.59 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  48.41 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.85 
 
 		 268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 147 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 148 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  47.15 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 166 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  41.14 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  32.79 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.31 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  43.31 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.61 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  42.19 
 
 		 149 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  42.75 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.97 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 290 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  35.47 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  40.41 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  49.49 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  46.03 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  43.55 
 
 		 143 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 168 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 147 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  40.44 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  40.44 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>