More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4941 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  75.7 
 
 
285 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
314 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  50.84 
 
 
314 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  50.84 
 
 
314 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
307 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
318 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
310 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
159 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
162 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
162 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
162 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
162 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
160 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
163 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
160 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  36.91 
 
 
188 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
160 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.76 
 
 
162 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  35.92 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
153 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
158 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
149 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.75 
 
 
157 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  34.75 
 
 
157 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
167 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  35.04 
 
 
158 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 
176 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 
177 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  49.45 
 
 
131 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
155 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 
165 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  37.3 
 
 
158 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  34.06 
 
 
157 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 
165 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  36.64 
 
 
161 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  35.43 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  32.12 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 
143 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
165 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  31.91 
 
 
177 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
149 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
147 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
147 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  36.15 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 
176 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  31.88 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  32.87 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  36.52 
 
 
149 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
106 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  31.85 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  34.11 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  37.29 
 
 
158 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.84 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  30.82 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  31.39 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5101  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>