More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5152 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
149 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  56.13 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
159 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  57.62 
 
 
212 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
150 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  56.16 
 
 
157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  55.48 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
162 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
162 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
162 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
160 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
160 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  53.29 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 
153 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  47.18 
 
 
176 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  39.62 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  43.8 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  45.99 
 
 
161 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  43.92 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  43.24 
 
 
177 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.26 
 
 
160 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
167 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 
157 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  39.6 
 
 
151 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
310 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.58 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 
161 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
148 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40.58 
 
 
165 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  40.15 
 
 
149 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 
154 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 
154 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 
154 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.57 
 
 
154 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.57 
 
 
178 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.75 
 
 
268 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.36 
 
 
193 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
318 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 
244 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  38.07 
 
 
307 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
155 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
168 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
295 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 
165 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
152 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
156 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  38.13 
 
 
170 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
148 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
149 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  42.74 
 
 
143 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  32.89 
 
 
168 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
172 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
156 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
169 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
172 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
167 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
156 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
171 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 
168 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 
149 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
165 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
314 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
314 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
314 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 
152 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 
160 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
152 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  46 
 
 
121 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  32.87 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>