More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1482 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 162 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 162 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  92.26 
 
 		 162 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  90.67 
 
 		 162 aa  285  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 160 aa  283  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  77.27 
 
 		 212 aa  260  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  77.27 
 
 		 158 aa  256  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  60.26 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  59.06 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  55.26 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  53.24 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  47.13 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  47.97 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  55.4 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  47.97 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  50.38 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  50.35 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  45.27 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 318 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  41.45 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  43.92 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  44.12 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  41.22 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 310 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  39.74 
 
 		 209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  42.36 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.96 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  42.96 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 307 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  43.66 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  41.89 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  42.25 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  51.43 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 295 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  51 
 
 		 290 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 193 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  40.14 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  36.49 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  44.85 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  51.06 
 
 		 280 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36.24 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.27 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  38.82 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.54 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  39.26 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 285 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.97 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 147 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 147 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>