More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3272 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 175 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  53.05 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  36.81 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  38.78 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.2 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.09 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  38.1 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  36.09 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  36.24 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 161 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.37 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  37.31 
 
 		 143 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  32.57 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  39.55 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  35.34 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 147 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  32.24 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 145 aa  94.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 155 aa  94.4  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  31.54 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  34.9 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  32.21 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 158 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  32.9 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 149 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  36.22 
 
 		 149 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  37.96 
 
 		 165 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  34.27 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  33.1 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  33.58 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  30.18 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  34.53 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  33.77 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  35.17 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  33.78 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  33.11 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  33.57 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  33.57 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>