More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1663 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
280 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  59.36 
 
 
290 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
163 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  46.77 
 
 
157 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
155 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 
159 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
156 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
175 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 
166 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 
161 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 
143 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
209 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
162 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
162 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
162 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
160 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
160 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 
153 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  44.03 
 
 
147 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
147 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  48.39 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
179 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  43.94 
 
 
187 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 
159 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
162 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  44.95 
 
 
193 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  43.12 
 
 
172 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
148 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  40.52 
 
 
168 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
150 aa  95.9  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
149 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  44.95 
 
 
178 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0745  redoxin domain protein  47.97 
 
 
191 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
160 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 
168 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2643  BcpB protein  36.63 
 
 
191 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0054553  hitchhiker  0.00830127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  42.02 
 
 
150 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 
158 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
171 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 
165 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
164 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4691  putative thiol-specific antioxidant related protein (thiol peroxidase Bcp)  42.76 
 
 
194 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0656684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 
151 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  44.66 
 
 
177 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  44.62 
 
 
157 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 
179 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
160 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  51.96 
 
 
161 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2964  Redoxin domain protein  37.27 
 
 
192 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1843  redoxin domain-containing protein  37.35 
 
 
188 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  45.16 
 
 
162 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
149 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 
149 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
193 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 
148 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
170 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07850  bacterioferritin comigratory protein BcpB  44.88 
 
 
158 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
149 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 
148 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 
107 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 
158 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.75 
 
 
188 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 
130 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3834  redoxin domain-containing protein  37.79 
 
 
191 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  53 
 
 
121 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
149 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
149 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
167 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
149 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
149 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 
148 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
160 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
172 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
172 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1080  redoxin  40.65 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.769287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 
168 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
172 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
152 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3470  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.07 
 
 
191 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.627829  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 
149 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 
131 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
156 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  44.76 
 
 
157 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 
166 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
156 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  40.95 
 
 
150 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>