More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3620 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  63.71 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  60.47 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  47.89 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  48.53 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  46.32 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.6 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  45.07 
 
 		 212 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 163 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  43.15 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  43.94 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  49.61 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  47.15 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  45.67 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  43.61 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  50.38 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.18 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  47.66 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.4 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  43.67 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  40.48 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  43.67 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  56.12 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  40.13 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  53.19 
 
 		 290 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.04 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  43.85 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 177 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 310 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.32 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  36.03 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.5 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.06 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  36.72 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 168 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 193 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  47.87 
 
 		 178 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  47.87 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  47.87 
 
 		 268 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  40.3 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  41.54 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 244 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  39.68 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 167 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  38.1 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 318 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  34.33 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>