More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4858 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  70.37 
 
 		 165 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  57.66 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  57.25 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  57.25 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  50.68 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  48.89 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  45.14 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  39.07 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  42.96 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  41.61 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.64 
 
 		 193 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.31 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.6 
 
 		 168 aa  97.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  51.04 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  39.73 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  38.3 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  37.25 
 
 		 212 aa  94.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  40.46 
 
 		 209 aa  94  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  35.67 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 121 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 290 aa  88.2  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  37.32 
 
 		 187 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 171 aa  87.8  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  40.77 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.8 
 
 		 147 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  33.81 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  37.3 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  32.65 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  33.59 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  36.51 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>