More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3356 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  77.7 
 
 		 150 aa  239  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  57.86 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  53.62 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  54.74 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  54.74 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  54.74 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  55.56 
 
 		 268 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  54.74 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  54.74 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 244 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  56.69 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  49.28 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  49.28 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 147 aa  129  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  50.36 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  50.36 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  51.8 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  51.8 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  51.54 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  46.72 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 179 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 152 aa  116  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44.85 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  37.96 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  38.17 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  43.28 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.04 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  42.14 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  42.96 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  46.6 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  45.37 
 
 		 177 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 209 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  43.27 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  47.96 
 
 		 158 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 290 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  45.16 
 
 		 212 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 183 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 183 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  41.43 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 168 aa  86.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.34 
 
 		 188 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>