More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1362 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  48.12 
 
 		 159 aa  133  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  48.3 
 
 		 177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  42.75 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.75 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  42.45 
 
 		 183 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  47.45 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  46.97 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 175 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  46.28 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  45.8 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  50.48 
 
 		 187 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  47.06 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  43.07 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  43.28 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  45.32 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  44.44 
 
 		 193 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  47.11 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  42.15 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  47.54 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  46.77 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44.29 
 
 		 290 aa  97.1  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  39.55 
 
 		 186 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.01 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  42.74 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 167 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  42.74 
 
 		 146 aa  94  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  38.73 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.35 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  48.35 
 
 		 170 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.29 
 
 		 268 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  44.35 
 
 		 178 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.34 
 
 		 188 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 244 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  46.32 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.88 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  38.13 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  38.85 
 
 		 166 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>