More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0547 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  296  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  89.73 
 
 		 147 aa  263  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  89.04 
 
 		 147 aa  263  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  82.19 
 
 		 147 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  60.87 
 
 		 179 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  59.42 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  59.42 
 
 		 244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  59.42 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  59.42 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  59.42 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  59.42 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  58.7 
 
 		 268 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  54.23 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 172 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 172 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  57.04 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  57.04 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  56.3 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  53.03 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 179 aa  150  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  55.07 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  55.22 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  52.27 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  55.81 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  54.48 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  55.81 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  51.54 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  48.09 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  48.97 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  47.73 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  40.44 
 
 		 170 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.88 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  45.86 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  47.24 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.77 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.54 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.98 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 175 aa  103  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.64 
 
 		 177 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  34.31 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 209 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 177 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 172 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.94 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.23 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.58 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  38.02 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  37.3 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  39.52 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.68 
 
 		 165 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 164 aa  85.9  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.86 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  33.8 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  42.42 
 
 		 212 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  42.42 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>