More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4908 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  313  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  89.74 
 
 
156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  89.1 
 
 
172 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  91.95 
 
 
156 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  89.1 
 
 
172 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  89.1 
 
 
156 aa  276  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  63.27 
 
 
148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  61.04 
 
 
178 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  61.04 
 
 
244 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  61.04 
 
 
154 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  61.04 
 
 
154 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  61.04 
 
 
154 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  60.81 
 
 
154 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  60.14 
 
 
268 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  59.86 
 
 
148 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  60.54 
 
 
149 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
149 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  60.42 
 
 
163 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  60.42 
 
 
163 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
149 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
149 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  54.11 
 
 
151 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  61.94 
 
 
135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  59.72 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  55.48 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  58.27 
 
 
147 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  56.08 
 
 
149 aa  168  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  58.27 
 
 
147 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  54.48 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  54.36 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  54.42 
 
 
152 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  54 
 
 
150 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  49.67 
 
 
152 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
179 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  54.48 
 
 
160 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  53.96 
 
 
148 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  51.7 
 
 
152 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  53.52 
 
 
147 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  52.05 
 
 
146 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  52.05 
 
 
146 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
154 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 
150 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 
150 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  49.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  42.14 
 
 
170 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.01 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.58 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 
147 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
168 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
163 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  39.22 
 
 
157 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 
171 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  41.79 
 
 
161 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 
168 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  41.48 
 
 
209 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.77 
 
 
188 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  54.35 
 
 
158 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  39.13 
 
 
177 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  35.51 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 
183 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 
183 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  39.19 
 
 
290 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  40.32 
 
 
176 aa  94.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  39.84 
 
 
170 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  36.92 
 
 
212 aa  90.9  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  37.14 
 
 
183 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  35.25 
 
 
187 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
145 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 
160 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 
177 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 
161 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
159 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.51 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>