More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1192 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  61.03 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  55.78 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  55.78 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  55.78 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  60.77 
 
 		 154 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  55.78 
 
 		 178 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  58.82 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  55.78 
 
 		 244 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  57.86 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  62.6 
 
 		 268 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  59.42 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  57.97 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  57.97 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  55 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  51.82 
 
 		 179 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 152 aa  147  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 179 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  51.91 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  51.09 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  50.35 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  44.85 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  41.01 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  49.46 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.27 
 
 		 188 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  41.73 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 177 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  45.05 
 
 		 177 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.15 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.27 
 
 		 193 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 209 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  51.06 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  31.69 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  39.37 
 
 		 212 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>