More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2274 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
161 aa  321  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  57.93 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  58.39 
 
 
176 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  53.24 
 
 
183 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  53.24 
 
 
183 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  55.47 
 
 
183 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
162 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  56.12 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  50.68 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
164 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  51.45 
 
 
212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  52.99 
 
 
157 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  50.38 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  45.99 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  48.53 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  51.8 
 
 
150 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 
153 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  46.31 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  46.48 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47.24 
 
 
159 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  47.45 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
158 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
158 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
158 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
193 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  58.76 
 
 
121 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  50.38 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
162 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  41.79 
 
 
162 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
318 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
170 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
155 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  45.53 
 
 
177 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
175 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  46.1 
 
 
168 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  45.6 
 
 
177 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  45.38 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  41.73 
 
 
153 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
310 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.08 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  47.93 
 
 
149 aa  97.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  48.7 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  48.7 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  48.7 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  48.7 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  48.7 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  48.7 
 
 
268 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  46.28 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  44.07 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  48.7 
 
 
244 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.62 
 
 
172 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
135 aa  94  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  44.07 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  38.69 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44.96 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  51.96 
 
 
280 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
163 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.79 
 
 
193 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  40 
 
 
171 aa  90.5  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>