More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0382 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  56.83 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  52.41 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  54.68 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  54.68 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  53.79 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  53.19 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  48.25 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  48.25 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  48.25 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  47.26 
 
 		 178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  47.26 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  49.29 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  47.26 
 
 		 244 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  47.26 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  51.05 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  47.26 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  47.26 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  50.35 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  46.58 
 
 		 268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.85 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 156 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  45.93 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  45.79 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  35.46 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  40.62 
 
 		 193 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 172 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  36.81 
 
 		 177 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 193 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  36.64 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 161 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  47 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  38.13 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  36.3 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  40.4 
 
 		 188 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 290 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  38.38 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 209 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.24 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>