More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2705 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  99.32 
 
 		 187 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  86.39 
 
 		 147 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  72.73 
 
 		 158 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  66.21 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  63.89 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  48.61 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  55.56 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 		 177 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  52.59 
 
 		 172 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  53.38 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  54.4 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  50.72 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  47.3 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  49.24 
 
 		 209 aa  123  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 168 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  55.1 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  50.48 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  49.49 
 
 		 212 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  46.23 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.96 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 290 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 280 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  41.48 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 186 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  38.33 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  38.33 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.33 
 
 		 268 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  37.96 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 244 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  40.65 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  40.65 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  48.39 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 193 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  40.78 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  36.5 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  47.31 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>