More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5249 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  376  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  49.65 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  47.48 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  50.4 
 
 		 147 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  41.83 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  41.83 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  43.36 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  44.83 
 
 		 165 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 160 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  47.26 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.15 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  44.06 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  42.47 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  49.11 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.87 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.97 
 
 		 170 aa  98.2  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  40.71 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.25 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.32 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  54 
 
 		 121 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  42.66 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  42.14 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 150 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.75 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  41.84 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 150 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  53.33 
 
 		 280 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 171 aa  91.3  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  40.13 
 
 		 158 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.3 
 
 		 148 aa  91.3  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 148 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 290 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 155 aa  89  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  39.87 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.01 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.86 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.44 
 
 		 157 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 152 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.75 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 149 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  44.35 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>