More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13112 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  47.18 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  45.07 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  46.41 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  47.89 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  44.76 
 
 		 212 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  45.32 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.8 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  48.53 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  46.21 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  50.82 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  46.83 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  43.07 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.26 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  47.18 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  43.06 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 310 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  43.26 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 318 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.32 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.62 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 307 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  39.01 
 
 		 209 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  52.17 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  52.17 
 
 		 268 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  52.17 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 244 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  42.96 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  36.88 
 
 		 177 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  47.71 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 295 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 175 aa  94.4  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  39.37 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>