More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1011 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 150 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 159 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  45.67 
 
 		 160 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 160 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 163 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  43.55 
 
 		 212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 164 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 170 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  43.55 
 
 		 153 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  42.15 
 
 		 157 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 160 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.69 
 
 		 162 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 158 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  42.98 
 
 		 157 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  41.73 
 
 		 176 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.19 
 
 		 157 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 		 143 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  42.52 
 
 		 157 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  45.9 
 
 		 149 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 165 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 166 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 		 161 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  40.98 
 
 		 151 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 183 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 183 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  39.32 
 
 		 165 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 156 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 165 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  37.4 
 
 		 183 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 148 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 148 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 175 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  42.74 
 
 		 177 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  40.16 
 
 		 193 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 135 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  34.92 
 
 		 170 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 155 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  40.3 
 
 		 149 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37.6 
 
 		 168 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  34.06 
 
 		 168 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  44.04 
 
 		 171 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 170 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 172 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  39.17 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.52 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  36.29 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  39.81 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.38 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.4 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  33.87 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 151 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>