More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2587 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  42.96 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  40.41 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  43.45 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  41.01 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.01 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.32 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.97 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  38.03 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  37.18 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  45.54 
 
 		 268 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 244 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  45.54 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  45.54 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  33.1 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  33.79 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  46.53 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  41.09 
 
 		 143 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 156 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  39.06 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 295 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 285 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.67 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 314 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 148 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 314 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 314 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.24 
 
 		 161 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 169 aa  90.9  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  42.24 
 
 		 290 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 151 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 148 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.23 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  45.79 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  39 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 145 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  36.76 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 177 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>