More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2035 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  321  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
147 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
147 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  55.64 
 
 
147 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
149 aa  153  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  50.71 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  50.71 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  50.71 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  50.71 
 
 
244 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  50.71 
 
 
178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  50.71 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
147 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  50 
 
 
268 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
156 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
172 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
172 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
156 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  47.14 
 
 
179 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
156 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
156 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  50 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  56.41 
 
 
148 aa  144  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
152 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  49.62 
 
 
152 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  54.7 
 
 
148 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  47.86 
 
 
146 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
135 aa  140  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  49.65 
 
 
149 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 
150 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
179 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
152 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  47.14 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  47.14 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  47.14 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  49.61 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
150 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  42.25 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.91 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  40.14 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 
170 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  46.53 
 
 
157 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  47.52 
 
 
157 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
155 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 
161 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  41.27 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
171 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  39.64 
 
 
170 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.19 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 
183 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 
183 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  35.66 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  35.61 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
172 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 
153 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 
290 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
193 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  40.21 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.61 
 
 
172 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
168 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  32.84 
 
 
193 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  41.3 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
165 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
165 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  34.51 
 
 
209 aa  87  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  41.49 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  32.37 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 
212 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>