More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5484 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  299  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  71.09 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  60.31 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  61.24 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 168 aa  151  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  45.8 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 165 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  45.07 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  44.36 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  43.36 
 
 		 193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.61 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  45.24 
 
 		 212 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.86 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  46.56 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.44 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.96 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.52 
 
 		 188 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  41.6 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 280 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.71 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 290 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 158 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  39.52 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  41.27 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  39.52 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 177 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 186 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 310 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 285 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 318 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  34.33 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  46.15 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 268 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  44.9 
 
 		 183 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.33 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 295 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  43.56 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  34.53 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>