More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2559 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  64.38 
 
 		 157 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  62.33 
 
 		 157 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 149 aa  194  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  57.05 
 
 		 188 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  56.08 
 
 		 159 aa  183  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 162 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 162 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  55.41 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 162 aa  176  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  55.41 
 
 		 212 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 153 aa  166  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  51.01 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  52 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 176 aa  146  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 170 aa  146  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  44.59 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  50.7 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  48.98 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 310 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 318 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  50.75 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  51.8 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  40.94 
 
 		 168 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.95 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  41.26 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42 
 
 		 193 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.27 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  46.56 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.93 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 168 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 290 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.3 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  43.07 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 193 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  47.66 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 314 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  44.95 
 
 		 178 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 268 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.26 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  40.58 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 244 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 314 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 314 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  34.67 
 
 		 186 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  36.91 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 307 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  37.58 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  47.93 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 183 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 183 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 295 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>