More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5284 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  62.68 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  58.57 
 
 		 172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  56.34 
 
 		 209 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  55.48 
 
 		 193 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  54.35 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  54.35 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  51.08 
 
 		 168 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  52.9 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 175 aa  137  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  53.33 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  49.64 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  51.64 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  50.41 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  51.18 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  44.37 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  50.39 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  43.85 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.84 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  43.97 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 167 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  45.24 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 244 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  45.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 268 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  44.53 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.46 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  42.19 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 151 aa  97.1  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.91 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  41.27 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  48.78 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  34.01 
 
 		 186 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  41.3 
 
 		 165 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  39.84 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  39.68 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  39.68 
 
 		 166 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 172 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 290 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 172 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  39.17 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  37.32 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  33.79 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 176 aa  87  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>