More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2459 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  63.92 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  66.45 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  61.39 
 
 		 161 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  59.21 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 175 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  52.87 
 
 		 168 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  52.23 
 
 		 168 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  52.76 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  53.94 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 145 aa  161  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 163 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  47.3 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  50.36 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  49.3 
 
 		 147 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  44.94 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 149 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  38.51 
 
 		 153 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  40.13 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40.29 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 160 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  38.12 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  41.01 
 
 		 148 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  40.41 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.73 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 147 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.69 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 147 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.79 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  46.36 
 
 		 148 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  42.47 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.3 
 
 		 154 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  44.17 
 
 		 166 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  47.54 
 
 		 147 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 159 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  43.85 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 179 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.86 
 
 		 165 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 135 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  98.6  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  47.47 
 
 		 131 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 147 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 150 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 156 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 149 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>