More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  340  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  58.6 
 
 		 172 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  59.12 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  53.21 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  58.6 
 
 		 161 aa  174  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  52.76 
 
 		 209 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  50.31 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 171 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  47.8 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 145 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  51.61 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  47.5 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  53.21 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  49.19 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  44.51 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  44.72 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  39.24 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  44.03 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  39.58 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.96 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.96 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  52.78 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  38.19 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  38.19 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  45.9 
 
 		 268 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  44.22 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  36.81 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.93 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  37.97 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  34.93 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  43.59 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  33.54 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  37.76 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  31.55 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 290 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 148 aa  90.9  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.6 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  37.68 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 131 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>