More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3736 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  266  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  66.42 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  63.7 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  62.96 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  64.66 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  64.66 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  64.66 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  64.66 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  64.66 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  64.66 
 
 		 244 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  63.91 
 
 		 268 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 172 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 172 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  64.89 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  64.89 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  60 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  58.65 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  61.83 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  58.65 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  58.65 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  56.39 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  58.02 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  53.79 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  53.33 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  52.67 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  53.33 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  52.99 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  49.19 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 171 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  46.1 
 
 		 177 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  55.43 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.55 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 175 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  46.77 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  44.96 
 
 		 168 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  45.8 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  46.56 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  48.91 
 
 		 188 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 209 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  55.06 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.98 
 
 		 172 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 172 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  46.9 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  39.68 
 
 		 212 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44.04 
 
 		 157 aa  93.6  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 183 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 183 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 177 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  42.73 
 
 		 183 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 176 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  35.43 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>