More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5780 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  348  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  60.37 
 
 		 168 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  51.88 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  48.59 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  42.67 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  38.79 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.13 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.67 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  36.53 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  40.77 
 
 		 143 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  41.04 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  36.73 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 147 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  33.13 
 
 		 177 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  94  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  40.3 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  31.33 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.23 
 
 		 212 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.23 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 160 aa  90.9  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.19 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 310 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 121 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 165 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 131 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  34.9 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  35.82 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  35.16 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  33.77 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  37.39 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  35.62 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  37.69 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>