More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1282 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
120 aa  244  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  63 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  55.67 
 
 
135 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  55.67 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  51 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  51 
 
 
104 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
143 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  50 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 
117 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
112 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
111 aa  90.5  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.76 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.65 
 
 
134 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
131 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
230 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  49.46 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
112 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 
114 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  48.39 
 
 
112 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  49.46 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  49.46 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  49.46 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  38.1 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  49.46 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  43.3 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  41.41 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  37.74 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.3 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  43.68 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  39.56 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  40.22 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.61 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>