More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1415 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  216  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  41.49 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  37.5 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  38.54 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  38 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  36.17 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 213 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38.46 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  35.79 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  35.11 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  34.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  33.68 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  30.19 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>