More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  68.47 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.74 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44.09 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  50 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  45.05 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  47.73 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  38.2 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 246 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  38.78 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  38.46 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>