More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3339 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  97.09 
 
 		 118 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4119  HxlR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4770  HxlR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3397  HxlR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2772  HxlR family transcriptional regulator  78.64 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  77.53 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  51 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  56.63 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  53.01 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  54.12 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  53.01 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  51.81 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  51.81 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  51.81 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  49.4 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  52.27 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  51.22 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  47.62 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50.6 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  45.88 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  48.19 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  50.56 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  50.5 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  54.22 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  47.37 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  54.02 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  48.19 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  48.19 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  45.45 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  53.01 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  51.76 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.58 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 180 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.78 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.58 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  47.5 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  49.4 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  49.43 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  49.43 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>