More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0802 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  72.92 
 
 
106 aa  148  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  67.35 
 
 
106 aa  140  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  63.54 
 
 
119 aa  136  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  57.94 
 
 
110 aa  133  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  59.41 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  58.76 
 
 
108 aa  128  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  56.84 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 
108 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  53.7 
 
 
110 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 
113 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  56.12 
 
 
121 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  52.48 
 
 
113 aa  117  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
119 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  58.24 
 
 
124 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  58.24 
 
 
124 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  56.84 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.88 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  55.1 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  51.55 
 
 
111 aa  114  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  53.12 
 
 
125 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
120 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  54.84 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  53.61 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  53.19 
 
 
126 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.98 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  52.53 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 
159 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.98 
 
 
107 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  52.13 
 
 
126 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  48.98 
 
 
107 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  52.13 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  52.13 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  52.13 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  52.13 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  52.13 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  52.69 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
115 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.98 
 
 
107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
124 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  53.4 
 
 
134 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  52.08 
 
 
122 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  51.04 
 
 
129 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 
160 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
117 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2476  transcriptional regulator  60.24 
 
 
87 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000150722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
117 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 
123 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 
105 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 
108 aa  104  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 
127 aa  104  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
151 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 
118 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  47.62 
 
 
113 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  47.62 
 
 
113 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  47.62 
 
 
113 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 
115 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
133 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 
118 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
122 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
114 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  46.67 
 
 
114 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 
118 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 
144 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 
129 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
114 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  52.58 
 
 
149 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  48.51 
 
 
114 aa  100  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 
130 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  48.51 
 
 
114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
115 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  48.51 
 
 
114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 
107 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  49.47 
 
 
154 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  52.13 
 
 
119 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 
117 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
159 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 
128 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
126 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  45.36 
 
 
116 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>