More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
111 aa  224  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  53.57 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
116 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  55.43 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  55.43 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  55.43 
 
 
129 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  55.32 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  55.43 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
120 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
115 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  50.54 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
124 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
111 aa  105  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  47.42 
 
 
114 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  47.42 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  51.02 
 
 
144 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  51.02 
 
 
144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  51.02 
 
 
144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  51.02 
 
 
144 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  51.02 
 
 
144 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
116 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
126 aa  103  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
108 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  51.02 
 
 
206 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  48.62 
 
 
141 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 
121 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  51.02 
 
 
220 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 
119 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
114 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 
113 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  51.11 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  51.06 
 
 
113 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47.78 
 
 
108 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
117 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.39 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  51.11 
 
 
114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  45.83 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
119 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
134 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 
108 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  45.83 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 
127 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  47.83 
 
 
110 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 
123 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 
159 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
139 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.35 
 
 
107 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 
151 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  49.45 
 
 
107 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  47.78 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  47.78 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  46.67 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  47.25 
 
 
107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
115 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 
130 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.25 
 
 
107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  47.78 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  47.78 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  47.78 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.54 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
118 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.79 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  48.35 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>