More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0252 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  61.17 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  60.61 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  47.57 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  51.06 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  51.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  56.52 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  50.55 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  52.13 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  47.17 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  55.43 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  54.35 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  54.35 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  45.63 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  55.06 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  41.8 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  46.32 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  49.46 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  46.81 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  49.48 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>