More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3041 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50.52 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  51.4 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  51.4 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  40.71 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  42.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  42.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  42.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.68 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  42.57 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  42.57 
 
 		 220 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  47.96 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.24 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.24 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  43.62 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.06 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  52.81 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  45.26 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  47.37 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  35.9 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.78 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  47.42 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>