More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2802 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  72.65 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 117 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  64.22 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  63.3 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  57.69 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  55.77 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  55.08 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  55.08 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  55.08 
 
 		 206 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  55.08 
 
 		 220 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  55.08 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  55.08 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  55.08 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  60.19 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  55.77 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  60.38 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  59.22 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  60.82 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  53.51 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  59.79 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  59.79 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  59.79 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  59.79 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  59.79 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  59.79 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  59.78 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  61.96 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  56.38 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  52.34 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  58.7 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  58.7 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  55.79 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  54 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  52.75 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  55.32 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  47.25 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  54.26 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  54.26 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  55.32 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  53.06 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  50.46 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  52 
 
 		 108 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  51.06 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>