More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1405 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  60.82 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  57.61 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  58.7 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  54.64 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  56.98 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  56.98 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  56.38 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  51.04 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  56.52 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  54 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  54 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  54 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  53 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  53 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  53 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  53 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  53.54 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  52.08 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  52 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  52 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  52 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  53.12 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 220 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  51.02 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  51.02 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  52.17 
 
 		 206 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  44.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  47.87 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  47.87 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>