More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  230  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  52.73 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  54.84 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  51.58 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  52.69 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  51.06 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.98 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  49.43 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  51.09 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  48.42 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  51.09 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.09 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.65 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  51.09 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48.91 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48.91 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48.91 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  46.59 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.45 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.79 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  46.88 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  46.88 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  46.88 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  40.43 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  40.43 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  46.74 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  46.74 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  46.39 
 
 		 206 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  46.39 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>