More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2765 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  256  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  78.07 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  63.3 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  57.84 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  51.33 
 
 		 235 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  52.53 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  51.43 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.61 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  43.14 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.12 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.14 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  45.36 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.81 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  44.12 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.57 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.57 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  43.3 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  43.3 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  42.57 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  43.3 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  48.42 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.26 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  43.86 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  37.72 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>