More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3293 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  92.44 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  76.58 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  70.8 
 
 		 121 aa  173  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  67.31 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  63.81 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  57.01 
 
 		 117 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  63.46 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  59.46 
 
 		 116 aa  126  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  54.05 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  55.79 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  49.47 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.98 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  48.18 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  49.02 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  52.63 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  49 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  47.52 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  47 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.22 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  52.08 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  47 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  46.24 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  47.31 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>